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聲波基因組剪切儀

型號:XM-2026A(單槽)/XM-30150A(雙槽)

品牌:小美超聲

規(guī)格:臺

產(chǎn)品簡介:聲波基因組剪切儀單槽/雙槽的研究領(lǐng)域:組蛋白的修飾研究、染色質(zhì)表觀遺傳修飾研究、轉(zhuǎn)錄調(diào)控分析、藥物開發(fā)研究、有絲分裂研究、DNA損傷與凋亡分析等。

高通量超聲波基因組剪切儀又名聚焦超聲波剪切儀,聲波基因組剪切儀,XM-M220單槽XM-ME220雙槽

高通量聲波基因組剪切儀是在傳統(tǒng)超聲波處理基礎(chǔ)上的技術(shù)革新,通過球面固態(tài)超聲換能器將聲波以 三維方式聚焦到樣本區(qū)域,聚焦聲波能夠以不同角度的能量輸入獲得良好的處理效果,避免傳統(tǒng)超聲能 量的不聚集可能引起的樣本處理過度及熱損傷。采用等溫、旋轉(zhuǎn)離心管及非接觸的方式對樣品進行打斷 ,勻漿和混合。用于無菌、超微量破碎,隔著離心管能打斷染色體。且不產(chǎn)生感染性飛霧,超聲探頭與樣 品不接觸,避免交叉污染。自動聲波聚焦通過精確的控制系統(tǒng)和自動化的冷水機操作,為樣本處理提供 高效可控、重復(fù)性優(yōu)良、溫度恒定及無污染的處理環(huán)境。目前已廣泛應(yīng)用于基因組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)、細胞 生物學(xué)等研究中。
·更短的波長-低至3mm波長,與生物樣本大小相同數(shù)量級,更容易聚焦。
·更集中的聲波-精確聚焦聲波至樣品區(qū)域,減少能量損失,帶來更低的功耗。
·更安靜更健康-臨床醫(yī)學(xué)級超聲頻率,處于安全聽力范圍之外,無噪音,對人體無害。

基本原理:
通過壓電轉(zhuǎn)換器,將電信號轉(zhuǎn)變?yōu)楦哳l聲波信號,產(chǎn)生數(shù)百萬的分子“空穴”,利用“空穴”在幾秒內(nèi)變大、破裂產(chǎn)生的瞬時流體剪切力,通過等溫、非接觸的方式對樣本進行打斷、勻漿和混合。

應(yīng)用領(lǐng)域:
組織破碎與勻漿、蛋白質(zhì)提取、蛋白質(zhì)消解、DBS血卡收集提取、MALDI-TOF樣本處理、細胞及亞細胞組分裂解、ccfDNA提取、ChIP染色質(zhì)剪切、DNA/RNA提取、生物標志物提取、DNA/RNA片段化、FFPE樣本核酸提取、配方設(shè)計、脂質(zhì)體制備、納米顆粒制備、化合物分散/溶解、藥物合成與微粉化

不同片段化方法的對比:
超聲波打斷法;

操作簡單,耗時短,成本低;
隨機片段化,無GC序列偏好;
剪切效果不受DNA濃度影響;
片段化結(jié)果集中度高.目的長度片段得率高。
酶切法:
實驗要求嚴格,針對不同樣本合適的片段化條件摸索不易,成本較高;
存在序列偏好性;
需要根據(jù)樣本濃度改變酶濃度,酶活性易受到溶液成分影響;
目標長度片段集中度較低。

傳統(tǒng)探頭和非接觸式的對比:
傳統(tǒng)探頭超聲波破碎儀

探頭與樣品直接接觸,有金屬離子污染,一次只能處理一個樣品,實驗周期長。
對于多個樣品,需要重復(fù)使用同一探頭,容易造成樣品交叉污染。
由于每次探頭插入樣品的深度不一,每次超聲的能量分布也不盡相同,影響實驗結(jié)果的重復(fù)性和準確性。
由于不能采用封閉系統(tǒng),在超聲過程中產(chǎn)生的氣霧或者泡沫會擴散到環(huán)境中,造成潛在的生物危險。
非接觸式超聲波破碎儀
消除了傳統(tǒng)的手持探頭,固定探頭的繁瑣。
消除了樣品交叉污染的危險;能隔著離心管能打斷染色體、破碎細胞。
無氣霧浮質(zhì)產(chǎn)生-增強生物安全性.用于無菌操作。

主要優(yōu)勢:
1.通量高:一次可同時處理30-60個樣品,實驗效率高
2.無需頻繁操作探頭:各樣品均在單獨的全封閉試管中,避免交叉污染
3.產(chǎn)品配置豐富,適合于不同樣品的實驗:適用之樣本管型式 0.1ml-15ml多種適配器
4.超聲參數(shù)設(shè)置靈活,實驗步驟標準化,實驗重復(fù)性好,結(jié)果可靠性高
5.無需特殊專用耗材,實驗成本低
6.采用4℃低溫水浴超聲波,能量分布均勻,超聲作用完全,樣品完全在低溫環(huán)境中進行,避免了樣品的變性

性能特點:
1.無需特殊耗材,操作簡單,時間快,通常一個實驗最短時間只需5分鐘
2.儀器配有旋轉(zhuǎn)馬達,超聲時自動連續(xù)旋轉(zhuǎn)離心管適配器,使超聲能量分布更均勻
3.采用7寸醫(yī)用級電阻觸摸屏觸控操作,屏幕實時顯示工作參數(shù)時間、溫度、功率及連續(xù)模式和間隙模式顯示,操作簡便,運行狀態(tài)倒計時顯示
4.微處理器設(shè)有密碼保護功能,內(nèi)置程序,可根據(jù)樣品類型,輸入不同的程序,達到實驗?zāi)康?,無需頻繁搜索實驗條件
5.儀器具有超電流、超電壓、超溫報警功能,當溫度超過設(shè)定溫度,自動停止超聲并報警,保證樣品的完整性

實驗效果:

1.gDNA不同起始量打斷效果
   
可對不同起始量的樣品體積進行打斷,可得到高重復(fù)的DNA剪切結(jié)果,不同初始樣本量均能得到一致性的片段。

2.全血片段對比:

3.不同投入量和不同超聲時長的測試結(jié)果:

在投入量分別是200ng時,通過Qsep100片段分析儀檢測,打斷的DNA片段在200-400bp區(qū)間占比分別是 47.7%、49.2%、49.1%;片段平均值分別是290.3bp、287.6bp、283.7bp, 在投入量分別是300ng時,通過Qsep100片段分析儀檢測,打斷的DNA片段在200-400bp區(qū)間占比分別是 49.4%、49.2%、49.3%;片段平均值分別是288.0bp、284.3bp、284.2bp, 說明該儀器打斷效果不錯,打斷片段峰形為單一峰形,較完整。

4.相同處理時長的樣本混合后,瓊脂糖凝膠電泳檢測結(jié)果:

圖2:處理時長相同的樣本(8組)均勻混合后電泳檢測結(jié)果 Marker 條帶從下往上依次為100bp、200 bp、300bp、400bp(最亮條帶)、500bp、600 bp。

技術(shù)參數(shù):

型號

XM-M220(單槽)

XM-ME220(雙槽)

超聲頻率

20-400KHz混頻超聲功能,頻率自適應(yīng)

總時間可調(diào)

0.1s-9999min,脈沖間隙時間可調(diào):0.1s-99.9s

超聲水槽容積

15*14*10cm

23*14*10cm

進口原裝多頻超聲換能器

4組

8組

超聲樣品體積

2mL以上或5μL以下

樣本處理數(shù)量

32*0.1ml,20*0.65ml,11*2ml以及5個5-15ml離心管

60*0.1ml,40*0.65ml,22*2ml以及10個5-15ml離心管

適配器材質(zhì)

316不銹鋼材質(zhì)

噪音等級

<55dB

冷卻系統(tǒng)

便攜式恒溫槽主機(壓縮機制冷)

溫控范圍

2-40℃

溫度讀數(shù)精確性

at 0.1℃

壓縮機功率

600W

研究領(lǐng)域:組蛋白的修飾研究、染色質(zhì)表觀遺傳修飾研究、轉(zhuǎn)錄調(diào)控分析、藥物開發(fā)研究、有絲分裂研究DNA損傷與凋亡分析等。

2024.05.23
高通量聲波基因組剪切儀對小鼠肝臟細胞核超聲實驗分享
超聲波破碎在分子生物學(xué)中一直被廣泛使用,高通量聲波基因組剪切儀則進一步提高了超聲波破碎的效率和準確性,使得研究人員能夠獲得更高質(zhì)量的基因組數(shù)據(jù)。這些高質(zhì)量的基因組數(shù)據(jù)對于生物科學(xué)和醫(yī)學(xué)研究具有重要意義。高通量聲波基因組剪切儀一次能夠處理30個樣品,這對于那些需要處理多個樣品或貴重樣品的研究人員來說,無疑是一個巨大的福音。且不需要使用昂貴的化學(xué)試劑和耗材,大大降低了實驗成本。
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